Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AtrxQ61687 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms