Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gli3Q61602 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gli3Q61602 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms