Protein–RNA interactions for Protein: Q61475

Cd55, Complement decay-accelerating factor, GPI-anchored, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55Q61475 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd55Q61475 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms