Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Msi1Q61474 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Msi1Q61474 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms