Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tfap2bQ61313 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tfap2bQ61313 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms