Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usf1Q61069 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usf1Q61069 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms