Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc1Q61056 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trpc1Q61056 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc1Q61056 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trpc1Q61056 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc1Q61056 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc1Q61056 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc1Q61056 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc1Q61056 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trpc1Q61056 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc1Q61056 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trpc1Q61056 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trpc1Q61056 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Trpc1Q61056 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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