Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ift20Q61025 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift20Q61025 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms