Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rbbp7Q60973 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rbbp7Q60973 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms