Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3Q60803 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3Q60803 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms