Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf3Q60765 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf3Q60765 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms