Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms