Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Xrcc1Q60596 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xrcc1Q60596 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xrcc1Q60596 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xrcc1Q60596 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xrcc1Q60596 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Xrcc1Q60596 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc1Q60596 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc1Q60596 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc1Q60596 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc1Q60596 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc1Q60596 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Xrcc1Q60596 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms