Protein–RNA interactions for Protein: Q5U406

Zfp78, Zinc finger protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp78Q5U406 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp78Q5U406 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp78Q5U406 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms