Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Brip1Q5SXJ3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Brip1Q5SXJ3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms