Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Med13Q5SWW4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med13Q5SWW4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms