Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Utp18Q5SSI6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms