Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r223Q5SSA0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r223Q5SSA0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms