Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm12253Q5NC48 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm12253Q5NC48 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm12253Q5NC48 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm12253Q5NC48 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Gm12253Q5NC48 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm12253Q5NC48 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm12253Q5NC48 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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