Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttf2Q5NC05 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttf2Q5NC05 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms