Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SynaQ5G5D5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms