Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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