Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

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Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Znf354cQ571J5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Znf354cQ571J5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Znf354cQ571J5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Znf354cQ571J5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Znf354cQ571J5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Znf354cQ571J5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Znf354cQ571J5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Znf354cQ571J5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Znf354cQ571J5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Znf354cQ571J5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Znf354cQ571J5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Znf354cQ571J5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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