Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rhox3aQ4TU90 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rhox3aQ4TU90 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms