Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm527Q4KL13 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm527Q4KL13 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm527Q4KL13 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm527Q4KL13 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms