Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx49Q4FZF3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Ddx49Q4FZF3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Ddx49Q4FZF3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx49Q4FZF3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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