Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Brinp3Q499E0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brinp3Q499E0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms