Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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Zfp235Q499D5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp235Q499D5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp235Q499D5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp235Q499D5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Zfp235Q499D5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp235Q499D5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Zfp235Q499D5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zfp235Q499D5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zfp235Q499D5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zfp235Q499D5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zfp235Q499D5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zfp235Q499D5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zfp235Q499D5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp235Q499D5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp235Q499D5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp235Q499D5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zfp235Q499D5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp235Q499D5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zfp235Q499D5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp235Q499D5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Zfp235Q499D5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Zfp235Q499D5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Zfp235Q499D5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Zfp235Q499D5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Zfp235Q499D5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Zfp235Q499D5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zfp235Q499D5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms