Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmub2Q3V209 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmub2Q3V209 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms