Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc185Q3V118 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms