Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc27Q3V036 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms