Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim40Q3UWA4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trim40Q3UWA4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms