Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BB287469Q3UT53 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms