Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm5460Q3UQ97 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms