Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
E130208F15RikQ3UPV3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms