Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmem253Q3UNB8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms