Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lrch2Q3UMG5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms