Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mccc2Q3ULD5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms