Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp19Q3UJD6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp19Q3UJD6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms