Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Edc4Q3UJB9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Edc4Q3UJB9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms