Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitpnm3Q3UHE1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.2 ms