Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Arfgef3Q3UGY8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arfgef3Q3UGY8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms