Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam35aQ3UEN2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fam35aQ3UEN2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms