Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kdm4dQ3U2K5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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