Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q3U1D9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q3U1D9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q3U1D9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U1D9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q3U1D9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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