Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc174Q3U155 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc174Q3U155 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms