Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Palb2Q3U0P1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms