Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mbd6Q3TY92 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms