Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccndbp1Q3TVC7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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