Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fndc4Q3TR08 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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